矩陣的研究歷史悠久，拉丁方陣和幻方在史前年代已有人研究。英文名Matrix（SAMND矩陣）。在數學名詞中，矩陣用來表示統計數據等方面的各種有關聯的數據。這個定義很好地解釋了Matrix代碼制造世界的數學邏輯基礎。
成書于西漢末、東漢初的《九章算術》用分離系數法表示線性方程組，得到了其增廣矩陣。在消元過程中，使用的把某行乘以某一非零實數、從某行中減去另一行等運算技巧，相當于矩陣的初等變換。但當時并沒有現在理解的矩陣概念，雖然它與現在的矩陣形式上相同，但在當時只是作為線性方程組的標準表示與處理方式。
矩陣的現代概念在19世紀逐漸形成。1801年德國數學家高斯（F.Gauss，1777~1855）把一個線性變換的全部系數作為一個整體。1844年，德國數學家愛森斯坦（F.Eissenstein，1823~1852）討論了“變換”（矩陣）及其乘積。1850年，英國數學家西爾維斯特（James Joseph Sylvester，18414-1897）首先使用矩陣一詞。1858年，英國數學家凱萊（A.Gayley，1821~1895）發表《關于矩陣理論的研究報告》。他首先將矩陣作為一個獨立的數學對象加以研究，并在這個主題上首先發表了一系列文章，因而被認為是矩陣論的創立者，他給出了現在通用的一系列定義，如兩矩陣相等、零矩陣、單位矩陣、兩矩陣的和、一個數與一個矩陣的數量積、兩個矩陣的積、矩陣的逆、轉置矩陣等。并且凱萊還注意到矩陣的乘法是可結合的，但一般不可交換，且m*n矩陣只能用n*k矩陣去右乘。1854年，法國數學家埃米爾特（C.Hermite，1822~1901）使用了“正交矩陣”這一術語，但他的正式定義直到1878年才由德國數學家費羅貝尼烏斯（F.G.Frohenius，1849~1917）發表。1879年，費羅貝尼烏斯引入矩陣秩的概念。
至此，矩陣的體系基本上建立起來了。
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